O Conjunto Habitacional José Bonifácio foi inaugurado em 1981. Foi o segundo núcleo da Cohab a ser entregue na região leste de São Paulo/SP.
A implementação dos conjuntos habitacionais foi uma forma que o Estado teria encontrado para resolver o problema da moradia para a região Leste de São Paulo, pois era um local de latifúndios improdutivos que teria servido de lazer às famílias paulistanas como a fazenda da família Morganti, onde hoje estão localizadas as COHABs II e III.
O crescimento populacional no extremo Leste da cidade São Paulo teve como fator predominante a construção da Cohab II. A década de 70 foi um período de expansão dessa região, em função das iniciativas adotadas pelo governo municipal de estímulo pela ocupação pelos contingentes populacionais que migravam para cidade.
Sobretudo, com resultados de movimentos sociais decorrente de moradores da localidade, começou a partir de então, o processo de desenvolvimento da infraestrutura no bairro. José Bonifácio é sobretudo um bairro residencial. Atualmente, conta com um pequeno setor comercial e diversificado. Os moradores têm acesso a diversos serviços como: abrigo de idosos, escolas, unidades de saúde, restaurantes, hipermercados, possui também terminal de ônibus e estação de trem (CPTM), centro poliesportivo, bibliotecas públicas, casa de cultura e Parque Municipal Raul Seixas.